Der Hauptunterschied zwischen assimilatorischer und dissimilatorischer Sulfatreduktion besteht darin, dass bei der assimilatorischen Sulfatreduktion Cystein als Endprodukt entsteht, während bei der dissimilatorischen Sulfatreduktion Sulfid als Endprodukt entsteht.
Die Sulfatreduktion ist einer der wichtigsten anaeroben Atemwege. Darüber hinaus können einige Mikroben, die von anaeroben Bedingungen abhängig sind, Sulfate reduzieren, um Energie zu gewinnen. Darüber hinaus gibt es zwei Hauptwege, auf denen Sulfate reduziert werden. Sie sind der Assimilationsweg und der Dissimilationsweg. Wobei auf dem Assimilationsweg die Reduktion von Sulfat Cystein als Endprodukt ergibt, das in lebenden Organismen wie Pflanzen und höheren Eukaryoten assimiliert werden kann. Im Gegenteil, der dissimilatorische Weg der Sulfatreduktion ergibt Sulfid als Endprodukt. Daher ist der signifikanteste unterscheidbare Unterschied zwischen assimilatorischer und dissimilatorischer Sulfatreduktion die Art des Endprodukts, das jedes Produkt produziert.
