Der Hauptunterschied zwischen Primer und Promotor besteht darin, dass der Primer eine kommerziell synthetisierte kurze DNA-Sequenz ist, die in der PCR zur Amplifikation einer Ziel-DNA-Sequenz verwendet wird, während der Promotor eine spezifische DNA-Sequenz ist, die eine sichere anfängliche Bindungsstelle für RNA-Polymerase und Transkriptionsfaktoren in bereitstellt um die Transkription zu initiieren.
Primer und Promotor sind zwei Arten von DNA-Sequenzen. Der Primer ist ein kleines DNA-Fragment, das für die Polymerasekettenreaktion (PCR) benötigt wird. Es hat kurze Nukleotidsequenzen, die zum flankierenden Ende des DNA-Strangs komplementär sind. Es gibt zwei Arten von Primern, die als Ausgangspunkte für die Synthese neuer DNA-Stränge dienen. Im Gegensatz dazu ist ein Promotor eine spezifische DNA-Sequenz, die sich stromaufwärts der Transkriptionsinitiationsstelle eines Gens befindet. Es interagiert direkt mit den Transkriptionsmechanismuskomponenten wie RNA-Polymerase und Transkriptionsfaktoren, um die DNA-Transkription zu steuern. Daher binden RNA-Polymerase und andere Transkriptionsfaktoren an die Promotorsequenz und initiieren die Transkription.
