Hauptunterschied - Genotypisierung vs. Sequenzierung
Genotypisierung und Sequenzierung sind zwei Techniken, die durchgeführt werden, um Informationen über die Nukleinsäuren zu erhalten, hauptsächlich über die DNA eines Organismus. Der Hauptunterschied zwischen Genotypisierung und Sequenzierung besteht darin, dass bei der Genotypisierung bestimmt wird, welche genetische Variante das Individuum unter Verwendung von Markern besitzt, während bei der Sequenzierung die korrekte Reihenfolge der Nukleotidsequenz innerhalb des gegebenen DNA-Fragments bestimmt wird.
INHALT
1. Überblick und Hauptunterschied
2. Was ist Genotypisierung
? 3. Was ist Sequenzierung?
4. Vergleich nebeneinander - Genotypisierung und Sequenzierung
5. Zusammenfassung
Was ist Genotypisierung?
Genotypisierung ist die Bestimmung des Erbguts eines Individuums unter Verwendung einer Sequenz von DNA und Markern sowie der Vergleich und die Identifizierung seiner Vererbung. Die Genotypisierung ist wichtig in der Evolutionsbiologie, Populationsbiologie, Taxonomie, Ökologie und Genetik der Organismen. Es kann durch verschiedene Techniken durchgeführt werden, einschließlich DNA-Sequenzierung, Polymerasekettenreaktion, Restriktionsfragmentlängenpolymorphismus (RFLP), zufälliger amplifizierter polymorpher Nachweis, amplifizierter Fragmentlängenpolymorphismus (AFLP), DNA-Mikroarrays usw.
Die Genotypisierung umfasst die Sequenzierung bestimmter kleiner Fragmente von DNA-Sequenzen und die Feststellung der Verwandtschaft der genetischen Zusammensetzung mit anderen Individuen unter Verwendung genetischer Marker. Es bestimmt die Einzelnukleotidpolymorphismen (SNPs) unter den Individuen oder den spezifischen Allelen. Die Genotypisierung ist auf eine Vielzahl von Organismen einschließlich des Menschen anwendbar. Es ist auch auf Mikroorganismen wie Viren, Pilze usw. anwendbar und kann verwendet werden, um ihre genetischen Varianten mit den Referenzprofilen zu bestimmen. In der molekularen Epidemiologie und forensischen Mikrobiologie erfolgt die Bekämpfung von Krankheitserregern, insbesondere von Mikroorganismen, anhand der aus der Genotypisierung gewonnenen Informationen. Die Genotypisierung ist in der Stammbaumanalyse sehr wichtig. Menschen werden genotypisiert, um Mutterschaft und Vaterschaft zu bestätigen. Der Genotyp zeigt die dominanten und rezessiven Allele von Genen, die bestimmte Merkmale bestimmen.
Abbildung 1: RFLP-Genotypisierung
Was ist Sequenzierung?
Bei der Sequenzierung wird die korrekte Reihenfolge des Nukleotids in einem bestimmten DNA- oder RNA-Fragment bestimmt. Nahezu alle Informationen, die für das Wachstum und die Entwicklung eines Organismus erforderlich sind, sind in seinem Genom kodiert. Die Verfügbarkeit von Techniken zur Herstellung und Trennung einiger hundert Nukleotide langer Nukleinsäurefragmente führte zur Entwicklung von Verfahren zur Bestimmung der genauen Nukleotidsequenz eines bestimmten DNA- oder RNA-Fragments. Heute stehen verschiedene Arten von Sequenzierungsmethoden zur Verfügung. Diese Sequenzierungsmethoden erleichtern zusammen mit den Technologien zum Aufbau von Genombibliotheken, die das gesamte Genom eines Organismus darstellen, die Sequenzierung des gesamten Genoms dieses Organismus und ermöglichen eine eingehende Analyse von Genstrukturen, Genfunktionen, Genorten, Genexpressionen, Genkartierung, Genregulationsregionen usw.
Das Gesamtgenom vieler Viren, mehrerer Bakterien, Archaebakterien, Hefen und einiger anderer Organismen wurde sequenziert und kartiert. Das Humangenomprojekt hat es ermöglicht, das gesamte Humangenom zu sequenzieren und abzubilden und seinen ersten Entwurf im Jahr 2003 zu veröffentlichen. Es ist ein wichtiger Meilenstein in der Weiterentwicklung der Biologie. Humangenomsequenzen werden heute im medizinischen Bereich verwendet, um genetische Ursachen für seltene Krankheiten zu identifizieren, das Krankheitsrisiko bei Neugeborenen zu untersuchen, genetische Details verschiedener Krebsarten zu identifizieren, neue Therapeutika zu entwickeln und neue diagnostische Instrumente zu entwickeln usw.
In der Pflanzenwelt wurden das Reisgenom und das Arabidopsis-Genom sequenziert. Die Kenntnis dieser Sequenzen wird zweifellos unser Verständnis der Funktionsweise von Zellen und Organismen revolutionieren.
Abbildung_2: Ein Autoradiogramm der Sanger-Sequenzierung
Was ist der Unterschied zwischen Genotypisierung und Sequenzierung?
Diff Artikel Mitte vor Tabelle
Genotypisierung vs Sequenzierung |
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| Genotypisierung ist der Prozess der Bestimmung der genetischen Zusammensetzung eines Individuums und der Überprüfung der Gruppe oder Taxonomie dieses Organismus. | Bei der Sequenzierung wird die genaue Reihenfolge der Nukleotide eines bestimmten DNA- oder RNA-Fragments bestimmt. |
| Techniken | |
| RFLP, Gensequenzierung, PCR, DNA-Microarrays, AFLP usw. | Sanger-Sequenzierung, Gilbert-Sequenzierung, Pyrosequenzierung, Next-Generation-Sequenzierung, Shotgun-Sequenzierung usw. |
| Hauptanliegen | |
| Dies ist eher besorgt darüber, ob die Genotypunterschiede die tatsächlichen Phänotypunterschiede ergeben. | Dies ist mehr besorgt über die Reihenfolge der Nukleotide und ihre Unterschiede und Veränderungen mit anderen Organismen. |
Zusammenfassung - Genotypisierung vs. Sequenzierung
Genotypisierung und Sequenzierung sind nützlich, um die genetische Information von Organismen zu untersuchen. Bei der Genotypisierung werden Genotypvariationen zwischen Individuen bestimmt und ihre Kategorien gefunden. Die Sequenzierung ist der Prozess der Bestimmung der korrekten Reihenfolge der Nukleotide im interessierenden Fragment oder in der Region der DNA. Beide Techniken liefern wichtige Informationen über die Gene und Genome.
