Der Hauptunterschied zwischen der Sequenzierung von Schrotflinten und der Sequenzierung der nächsten Generation besteht darin, dass die Sequenzierung von Schrotflinten eine Sequenzierungsmethode ist, die DNA-Sequenzen zufällig in viele kleine Fragmente aufteilt und die Sequenz durch Beobachtung der überlappenden Regionen wieder zusammensetzt, während die Sequenzierung der nächsten Generation (Next Generation Sequencing, NGS) eine fortschrittliche Methode von ist genetische Sequenzierung, die von der Kapillarelektrophorese abhängt.
Die Sequenzierung ist der Prozess, der die genaue Reihenfolge der Nukleotide in einem Gen, einem Cluster von Genen, einem Chromosom und einem vollständigen Genom bestimmt. In Genomstudien, forensischen Studien, Virologie, biologischer Systematik, medizinischer Diagnose, Biotechnologie und in vielen anderen Bereichen ist es sehr wichtig, die Struktur und Funktion von Genen und die Identifizierung von Organismen zu analysieren. Darüber hinaus stehen verschiedene Arten von Sequenzierungsmethoden zur Verfügung. Shotgun Sequencing und Next Generation Sequencing sind zwei fortschrittliche Methoden.