Der Hauptunterschied zwischen Kandidatengen und GWAS besteht darin, dass der Ansatz von Kandidatengenen die genetische Variation innerhalb einer kleinen Anzahl von vordefinierten interessierenden Genen untersucht, während GWAS das gesamte Genom auf eine gemeinsame genetische Variation hinter einem bestimmten Krankheitszustand untersucht.
Kandidatengenansatz und genomweite Assoziationsstudien (GWAS) sind zwei Methoden, die wichtig sind, um die genetische Anfälligkeit für Krankheiten festzustellen. Der Ansatz für Kandidatengene basiert auf einer vorgegebenen kleinen Anzahl von Genen, während GWAS auf dem Testen des gesamten Genoms basiert. Daher erfordert der Ansatz von Kandidatengenen im Gegensatz zu GWAS Vorkenntnisse über Gene, die für die Krankheit relevant sind.