Der Hauptunterschied zwischen QTL und GWAS hängt von der Art der in der Analyse verwendeten Sequenzen ab. QTL verwendet Verknüpfungsgenorte, um phänotypische Merkmale zu analysieren, die mit der polygenen Vererbung verbunden sind, während GWAS ganze Genomsequenzen verwendet, um einzelne Nukleotidpolymorphismen eines bestimmten Zustands zu analysieren.
QTL-Karten und GWAS spielen eine wichtige Rolle bei der genetischen Analyse verschiedener Merkmale. Darüber hinaus sind sie wichtig für die Analyse verschiedener Krankheitszustände mit unbekannter Ätiologie. Darüber hinaus spielt die Sequenzierung bei beiden Techniken eine Schlüsselrolle. Diese Techniken können ferner mit anderen Hochdurchsatztechniken gekoppelt werden, um die Genauigkeit und Präzision zu erhöhen.
