Der Hauptunterschied zwischen Krebszyklus und Glykolyse besteht darin, dass der Krebszyklus, der in Mitochondrien stattfindet, die zweite Stufe der Zellatmung ist, während die Glykolyse, die im Zytoplasma stattfindet, die erste Stufe der Zellatmung ist.
Krebszyklus und Glykolyse sind zwei Hauptstadien der Zellatmung, die Energie in Zellen produzieren. Beide Prozesse finden an verschiedenen zellulären Orten statt. Darüber hinaus verwenden sie unterschiedliche enzymatische Reaktionen, um unterschiedliche Ausgangsmaterialien in unterschiedliche Produkte umzuwandeln. Darüber hinaus erzeugen diese beiden Prozesse unterschiedliche Mengen an ATP. Bei der aeroben Atmung folgt der Krebszyklus der Glykolyse. Bei der anaeroben Atmung findet die Glykolyse jedoch allein statt.