Der Hauptunterschied zwischen parasitären Wurzeln und Mykorrhizen besteht darin, dass parasitäre Wurzeln die Wurzeln nicht photosynthetischer parasitärer Pflanzen sind, während Mykorrhizen eine Art wechselseitiger Assoziation zwischen den Wurzeln der photosynthetischen höheren Pflanze und einem Pilz sind.
Parasitismus und Gegenseitigkeit sind zwei symbiotische Assoziationen zwischen zwei verschiedenen Arten, die zusammen leben. Parasitismus ist nur für Parasiten von Vorteil, da der Parasit Lebensmittel und andere Anforderungen vom Wirt erhält, während er ihn schädigt. Auf der anderen Seite kommt der Gegenseitigkeit beiden Partnern zugute, die dem Verein angehören. Mykorrhizen sind eine Art von wechselseitiger Assoziation, die zwischen einer höheren Pflanze und einem Pilz auftritt. Der Pilz lebt in den Wurzeln höherer Pflanzen. Höhere Pflanzen versorgen den Pilz mit Nahrungsmitteln, während der Pilz Wasser und Nährstoffe vom Boden zur Pflanze aufnimmt.
