Der Hauptunterschied zwischen Flechten und Mykorrhizen besteht darin, dass Flechten eine wechselseitige Assoziation zwischen einem Algen / Cyanobakterium und einem Pilz sind, während Mykorrhiza eine Art wechselseitiger Assoziation zwischen Wurzeln einer höheren Pflanze und einem Pilz ist.
Gegenseitigkeit ist eine der drei Arten der Symbiose, die zwischen zwei verschiedenen Arten von Organismen auftritt. Im Gegensatz zu den beiden anderen Typen kommt die Gegenseitigkeit beiden Partnern zugute, die Mitglied der Vereinigung sind. Flechten und Mykorrhizen sind zwei häufige Beispiele für wechselseitige Assoziationen. Beides sind ökologisch wichtige Beziehungen. Zwei Parteien der Flechte sind Algen oder Cyanobakterien und ein Pilz. Andererseits sind zwei Parteien der Mykorrhizen Wurzeln einer höheren Pflanze und eines Pilzes.
