Der Hauptunterschied zwischen Alpha- und Beta-Anomeren besteht darin, dass im Alpha-Anomer die Hydroxylgruppe am anomeren Kohlenstoff cis zum exocyclischen Sauerstoff am anomeren Zentrum ist, während im Beta-Anomer die Hydroxylgruppe zum exocyclischen Sauerstoff trans ist.
Ein Anomer ist eine geometrische Variation zwischen Kohlenhydraten. Es ist eine Art Epimer, in dem wir ein anomeres Kohlenstoffatom sehen können. Ein anomeres Kohlenstoffatom leitet sich vom Carbonylkohlenstoff der offenkettigen Struktur des Kohlenhydrats ab. Daher wird die Bildung der cyclischen Struktur aus der offenkettigen Struktur als Anomerisierung bezeichnet.