Der Hauptunterschied zwischen Alpha und Beta-Tubulin besteht darin, dass das Alpha-Tubulin Asp-254 an der E-Stelle enthält, während das Beta-Tubulin Lys-254 an der N-Stelle enthält. Abgesehen davon ist GTP immer an die Alpha-Tubulin-Untereinheit gebunden, während an der Beta-Tubulin-Untereinheit GTP gegen Polymerisation der Mikrofilamente ausgetauscht werden kann.
Mikrotubuli sind Teil des Zytoskeletts des Zytoplasmas eukaryotischer Zellen. Daher existieren Mikrotubuli als ein Netzwerk von Proteinfilamenten, die in der Zelle verteilt sind und der Zelle eine bestimmte Form verleihen und die Organellen an Ort und Stelle halten. Darüber hinaus bestehen sie aus zwei Haupttubulinproteinen, nämlich Alpha- und Beta-Tubulinen. Alpha und Beta sind zwei Familien der eukaryotischen Tubulin-Superfamilie. Alpha und Beta Tubulin existieren als Dimer und sind der Grundbaustein von Mikrotubuli.