Der Hauptunterschied zwischen Polysaccharid- und Konjugat-Impfstoffen besteht darin, dass Polysaccharid-Impfstoffe nur freie Polysaccharide als Antigene enthalten, während konjugierte Impfstoffe Polysaccharide in Kombination mit einem Proteinmolekül enthalten.
Polysaccharid- und Konjugat-Impfstoffe sind zwei Arten von Impfstoffen. Polysaccharid-Impfstoffe enthalten nur die Polysaccharid-Kapsel als Antigen zur Stimulierung einer Immunantwort. Daher verursachen sie im Vergleich zu konjugierten Impfstoffen eine vernachlässigbare Immunantwort. Konjugatimpfstoffe enthalten Polysaccharide, die an ein immunogenes Protein konjugiert sind. Daher provozieren sie eine stärkere Immunantwort. Darüber hinaus etablieren konjugierte Impfstoffe das B-Zell-Gedächtnis und die Langzeitimmunisierung. Gegenwärtig haben konjugierte Impfstoffe die Polysaccharid-Impfstoffe weitgehend ersetzt.