Der Hauptunterschied zwischen konjugierter Säure und konjugierter Base besteht darin, dass konjugierte Säuren Protonen abgeben, während konjugierte Basen Protonen akzeptieren.
1923 stellten zwei Wissenschaftler, Bronsted und Lowry, eine Theorie zum Säure-Base-Verhalten vor. Nach der Bronsted-Lowry-Theorie ist eine Säure ein Protonendonor und eine Base ein Protonenakzeptor. Daher sollte ein Molekül, das sich wie eine Säure verhält, auf einen Protonenakzeptor treffen. Andererseits sollte ein Molekül, das sich als Base verhält, auf einen Protonendonor treffen. Daher sollten für eine Säure-Base-Reaktion sowohl Protonendonoren als auch Akzeptoren vorhanden sein. Wasser kann jedoch sowohl als Säure als auch als Base wirken. Wenn Wasser ein Proton akzeptiert, bildet es ein Hydroniumion, und wenn es ein Proton abgibt, erzeugt es ein Hydroxidion.