Der Hauptunterschied zwischen Mesoderm und Mesenchym besteht darin, dass Mesoderm eine der drei Keimschichten bilateral symmetrischer Tiere ist, während Mesenchym ein undifferenziertes Gewebe ist, das im embryonalen echten Mesoderm vorkommt.
Bei diploblastischen Tieren ist der Körperplan mit zwei Zellschichten relativ einfach. Die zwei Schichten sind das äußere Ektoderm und das innere Endoderm. Die Ektodermzellen sind der Umgebung zugewandt, und die Endodermzellen sind dem Enteron zugewandt, einem Hohlraum mit einer einzigen Öffnung nach außen. Die Öffnung ist der Mund. Darüber hinaus ist der triploblastische Zustand der Zustand, in dem sich im Embryo eine dritte Schicht entwickelt, die als Mesoderm bekannt ist. Das Mesoderm liegt zwischen dem Ektoderm und dem Endoderm und trennt die beiden Zellschichten. Die dritte Schicht ist wichtig für den Körper. Bei bestimmten Tieren bleibt ein Großteil des Mesoderms undifferenziert und bildet ein Packungsgewebe, das als Mesenchym bekannt ist und die Organe des Körpers stützt und schützt.
