Der Hauptunterschied zwischen formeller und informeller Organisation besteht darin, dass formelle Organisationen gebildet werden, um ein gemeinsames Ziel mit offiziellen Beziehungen zwischen Mitgliedern zu erreichen, während informelle Organisationen innerhalb formeller Organisationen gebildet werden, die auf zwischenmenschlichen Beziehungen zwischen Mitgliedern der Organisation beruhen.
Sowohl formelle als auch informelle Organisationskonzepte sind miteinander verbunden. Dies liegt daran, dass es innerhalb formeller Organisationen viele informelle Organisationen gibt. Darüber hinaus ist eine formelle Organisation, die von vielen informellen Organisationen unterstützt wird, eine effiziente und zufriedenstellende Organisation.