Hauptunterschied - Exom gegen Transkriptom
Ein Gen enthält kodierende und nicht kodierende Regionen. Codierungssequenzen sind als Exons bekannt, und nichtcodierende Sequenzen sind als Introns bekannt. Die Nukleotidsequenz der Exons eines Gens repräsentiert den genetischen Code des Gens zur Synthese des spezifischen Proteins. Daher verbleiben Exons im mRNA-Molekül. Die gesamte Exonregion des Genoms ist als Exom bekannt und ein wichtiger Teil des Genoms. Der genetische Code der Gene wird in den genetischen Code des mRNA-Moleküls umgewandelt, der für die Produktion von Protein benötigt wird. Die gesamten mRNA-Moleküle, die gleichzeitig in einer Zelle oder einer Zellpopulation transkribiert wurden, werden als Transkriptom bezeichnet. Der Hauptunterschied zwischen Exom und Transkriptom besteht darin, dass das Exom die Sequenzen der Exonregionen des Genoms darstellt, während das Transkriptom die gesamte mRNA einer Zelle oder eines Gewebes zu einem bestimmten Zeitpunkt darstellt.
INHALT
1. Überblick und
Hauptunterschied 2. Was ist Exom?
3. Was ist Transkriptom?
4. Vergleich nebeneinander - Exom gegen Transkriptom.
5. Zusammenfassung
Was ist Exome?
Gene bestehen aus Exons, Introns und regulatorischen Sequenzen. Exons sind die Genregionen, die während der Transkription in die mRNA-Sequenz transkribiert werden. Introns und andere nichtkodierende Regionen werden während der Transkription entfernt. Die Nukleotidsequenz von Exons bestimmt den genetischen Code des Gens, das das spezifische Protein synthetisiert, das es codiert. Nur Exons verbleiben innerhalb der mRNA eines Proteins. Die Sammlung von Exons im Genom ist als Exom eines Organismus bekannt. Es stellt einen Teil des Genoms dar, der in Genen exprimiert wird. Beim Menschen macht das Exom 1% des Genoms aus. Es ist der Protein-kodierende Teil des menschlichen Genoms.
Abbildung 01: Exome
Was ist Transkriptom?
Das Transkriptom ist die Sammlung aller proteinkodierenden und nichtkodierenden Transkripte (RNAs) in einem bestimmten Gewebe. Das Transkriptom repräsentiert die Sammlung von gesamten mRNA-Molekülen, die von den Genen in einer Zelle oder einem Gewebe exprimiert werden. Das Transkriptom einer Zelle kann mit dem Transkriptom eines anderen Zelltyps variiert werden. Das Transkriptom ist auch dynamisch - es ändert sich mit der Zeit als Reaktion auf interne und externe Reize. Selbst innerhalb desselben Gewebes oder innerhalb desselben Zelltyps kann sich das Transkriptom nach wenigen Minuten ändern.
Das Transkriptom unterscheidet sich vom Exom eines Organismus. Das Transkriptom enthält nur die exprimierten Exomsequenzen. Obwohl das Exom einer Zelle gleich bleibt, unterscheidet sich das Transkriptom zwischen den Zellen, da die Genexpression nicht für alle Zellen oder Gewebe gleich ist. In verschiedenen Zellen und Geweben werden nur essentielle Gene exprimiert. Die Genexpression ist ein gewebe- oder zelltypspezifischer Prozess. Es wird durch verschiedene Faktoren reguliert, einschließlich Umweltfaktoren. Daher kann das Transkriptom mit den äußeren Umgebungsbedingungen variieren.
Das Transkriptom wird als Vorstufe für Proteomikstudien verwendet. Alle Proteine stammen aus mRNA-Sequenzen. Translationale Modifikationen können zu Veränderungen der Proteine führen. Das Transkriptom liefert jedoch wichtige grundlegende Informationen für die Proteomstudien.
Abbildung 02: Transkriptom embryonaler Stammzellen
Was ist der Unterschied zwischen Exom und Transkriptom?
Diff Artikel Mitte vor Tabelle
Exom gegen Transkriptom |
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| Exom ist die Sammlung der Protein-kodierenden Region der Gene. | Das Transkriptom ist die Sammlung aller transkribierten RNA einschließlich mRNA. |
| Stichprobe | |
| Das Exom wird unter Verwendung einer DNA-Probe untersucht. | Das Transkriptom wird unter Verwendung einer RNA-Probe untersucht. |
| Studienmethode | |
| Die Sequenzierung des gesamten Exoms ist die Methode zur Untersuchung des Exoms. | Die RNA-Sequenzierung ist die Methode zur Untersuchung des Transkriptoms. |
Zusammenfassung - Exome vs Transcriptome
Exons sind die codierenden Sequenzen der Gene und bestimmen die mRNA-Sequenzen der Proteine. Die Sammlung dieser codierenden Sequenzen (Exons) ist als Exom eines Organismus bekannt. Gene werden vor der Herstellung von Proteinen in mRNA-Moleküle transkribiert. Die gesamten mRNA-Moleküle einer Zelle oder eines Gewebes zu einem bestimmten Zeitpunkt werden als Transkriptom bezeichnet. Das Transkriptom repräsentiert die Gene, die zu einem bestimmten Zeitpunkt aktiv in mRNA exprimiert werden. Das Transkriptom ist zell- und gewebespezifisch und beeinflusst die Umgebungsbedingungen. Dies ist der Unterschied zwischen Exom und Transkriptom.
