Der Hauptunterschied zwischen Photosynthese und Photorespiration besteht darin, dass bei der Photosynthese Photoautotrophe, hauptsächlich Grünpflanzen, Algen und Cyanobakterien, aus der Energie im Sonnenlicht Kohlenhydrate und Sauerstoff aus Kohlendioxid und Wasser erzeugen, während Photorespiration eine Nebenreaktion ist, bei der das Enzym eine Nebenreaktion darstellt RuBisCO sauerstoffhaltiges RuBP, wodurch ein Teil der durch die Photosynthese erzeugten Energie verschwendet wird.
Photosynthese und Photorespiration sind zwei Prozesse, die in Pflanzen auftreten. Die Photosynthese ist jedoch ein wichtiger Prozess, während die Photorespiration ein verschwenderischer Prozess ist. Ein Teil der Energie und des fixierten Kohlenstoffs wird durch die Photorespiration des Enzyms RuBP-Oxygenase-Carboxylase verschwendet. Daher kann Photorespiration als ein Prozess bezeichnet werden, der die Effizienz der Photosynthese in Pflanzen verringert.