Hauptunterschied - Stapelgel gegen Trenngel
Die Begriffe Stapelgel und Trenngel werden zur Erläuterung der SDS-PAGE-Technik verwendet. Die SDS-PAGE- oder Natriumdodecylsulfat-Polyacrylamid-Gelelektrophorese ist eine Labortechnik, mit der Proteinmoleküle anhand ihres Molekulargewichts getrennt werden. Die Theorie hinter der Technik ist, dass Proteine mit unterschiedlichen Molekulargewichten unterschiedliche Migrationsraten zeigen; Moleküle mit niedrigem Molekulargewicht wandern schneller, während Moleküle mit hohem Molekulargewicht langsam wandern. Das Medium für die Migration ist ein Gel. Es gibt zwei Arten von Gelen, die als Stapelgel und Trenngel bezeichnet werden. Der Hauptunterschied zwischen Stapelgel und Trenngel besteht darin, dass der pH-Wert des Stapelgels 6,8 beträgt, während der pH-Wert des Trenngels 8,8 beträgt.
INHALT
1. Überblick und Hauptunterschied
2. Was ist Stapelgel
? 3. Was ist Trenngel?
4. Beziehung zwischen Stapelgel und Trenngel.
5. Vergleich nebeneinander - Stapelgel und Trenngel in tabellarischer Form.
6. Zusammenfassung
Was ist Stapelgel?
Das Stapelgel ist ein niedrig konzentriertes Polyacrylamidgel, das in SDS-PAGE-Technik auf ein konzentrierteres Auflösungsgel (Trenngel) gegeben wird. Das Stapelgel wird verwendet, um die Auflösung der Elektrophorese zu verbessern. Die Auflösung steigt aufgrund des Unterschieds zwischen den Konzentrationen des Stapelgels und des Auflösungsgels, die sich auf die Proteine in der Probe auswirken. Da die Konzentration von Polyacrylamid im Stapelgel niedrig ist, ist die Porengröße höher. Dies hilft auch bei der Erhöhung der Trennung.
Das Stapelgel ist ein loses Polyacrylamidgel mit großen Poren von etwa 7% Polyacrylamid. Diese Poren wirken nicht als wesentliche Barriere für große Proteinmoleküle. Daher beeinflusst dieses Gel die Mobilität dieser Proteine geringfügig. Dies bewirkt eine Trennung entsprechend der Mobilität und Größe des Proteins, indem es zwischen zwei Gelen konzentriert wird.
Abbildung 01: SDS-PAGE-Acrylamidgel
Der pH-Wert des Stapelgels beträgt 6,8. Sein pH-Wert ist um 2 pH-Einheiten sauer als der des auflösenden Gels. Dieser pH-Wert impliziert eine geringere Ionenstärke und damit einen höheren elektrischen Widerstand. Dies provoziert die Mobilität von Proteinen als andere geladene Teilchen, die im Gel vorhanden sind.
Was ist Trenngel?
Trenngel oder Auflösungsgel einer SDS-PAGE-Technik ist ein hochkonzentriertes Polyacrylamidgel, das auf ein niedrig konzentriertes Stapelgel aufgetragen wird. Das Trenngel enthält eine hohe Menge an Polyacrylamid (10%). Der pH-Wert dieses Gels wird auf pH = 8,8 gehalten, was einem höheren pH-Wert als dem des Stapelgels entspricht.
Abbildung 02: Eine Gelelektrophoresevorrichtung
Wenn die Proteinmoleküle das Trenngel erreichen, wird die Migration dieser Moleküle verlangsamt, da das Trenngel ein hochkonzentriertes Gel mit einer kleinen Porengröße ist, das als beträchtliche Barriere für die Bewegung der Proteinmoleküle wirken kann. Diese Verlangsamung ermöglicht es den anderen Proteinen, langsam zu wandern, aufzuholen, was zu einer schmalen, konzentrierten Bande zwischen den beiden Gelen führt.
Welche Beziehung besteht zwischen Stapelgel und Trenngel?
Sowohl Stapelgel- als auch Trenngel-Typen werden in derselben Vorrichtung verwendet
Was ist der Unterschied zwischen Stapelgel und Trenngel?
Diff Artikel Mitte vor Tabelle
Stapelgel gegen Trenngel |
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Das Stapelgel ist ein niedrig konzentriertes Polyacrylamidgel, das in SDS-PAGE-Technik auf ein konzentrierteres Auflösungsgel (Trenngel) gegeben wird. | Trenngel oder Auflösungsgel einer SDS-PAGE-Technik ist ein hochkonzentriertes Polyacrylamidgel, das auf ein niedrig konzentriertes Stapelgel gegeben wird. |
Platzierung | |
Das Stapelgel wird auf das auflösende (trennende) Gel gegeben. | Das Trenngel wird auf den Boden des Behälters gegeben, der für die Gelelektrophorese verwendet wird. |
Konzentration | |
Die Konzentration an Stapelgel ist hoch. | Die Konzentration des Trenngels ist gering. |
Polyacrylamidgehalt | |
Das Stapelgel enthält etwa 7% Polyacrylamid. | Das Trenngel enthält etwa 10% Polyacrylamid. |
pH | |
Der pH-Wert des Stapelgels beträgt 6,8. | Der pH-Wert des Trenngels beträgt 8,8. |
Porengröße | |
Im Stapelgel sind große Porengrößen vorhanden. | Im Trenngel sind kleine Porengrößen vorhanden. |
Auflösung | |
Das Stapelgel ergibt eine bessere Auflösung. | Trenngel ergibt eine schlechte Auflösung. |
Zusammenfassung - Stapelgel gegen Trenngel
Stapelgel und Trenngel sind zwei Arten von Polyacrylamidgelen, die zur besseren Trennung von Proteinmolekülen in einer bestimmten Probe verwendet werden. Der Unterschied zwischen Stapelgel und Trenngel besteht darin, dass der pH-Wert des Stapelgels 6,8 beträgt, während der pH-Wert des Trenngels 8,8 beträgt.