Der Hauptunterschied zwischen Phagozytose und Opsonisierung besteht darin, dass die Phagozytose ein Mechanismus ist, der von bestimmten Zellen oder Organismen ausgeführt wird, um Fremdpartikel aufzunehmen oder zu verschlingen, während die Opsonisierung der Prozess ist, bei dem Krankheitserreger aus dem System entfernt werden, wenn sie mit Opsoninen markiert werden.
Immunologische Reaktionen können angeboren oder adaptiv sein. Krankheitserreger besitzen Rezeptoren zur Erkennung von Krankheitserregern, die die Identifizierung durch den Wirt erleichtern. Opsonisierung und Phagozytose sind zwei immunologische Reaktionen. Bei der Opsonisierung identifiziert und markiert der Wirt eindringende Partikel zur Zerstörung durch die Produktion von Opsoninen. Phagozytose ist ein Mechanismus, durch den bestimmte Immunzellen eindringende Partikel oder Fremdpartikel aus dem Körper verschlingen und zerstören.