Der Hauptunterschied zwischen Heterochromatin und Euchromatin besteht darin, dass Heterochromatin die hochgepackte Form von Chromatin ist, die im Allgemeinen inaktiv ist, während Euchromatin die lose gepackte Form von Chromatin ist, die im Allgemeinen aktiv ist.
Chromatin ist die Struktur, die den DNA-Strang eines Chromosoms enthält. Heterochromatin und Euchromatin sind die beiden Haupttypen von Chromatin, die in den Zellen vorhanden sind. Es gibt einen Unterschied zwischen Heterochromatin und Euchromatin in Bezug auf Struktur und Funktion. Darüber hinaus unterscheiden sie sich auch von den Transkriptions- und Replikationseigenschaften.