Der Hauptunterschied zwischen interspezifischer und intraspezifischer Hybridisierung besteht darin, dass eine interspezifische Hybridisierung zwischen zwei verwandten Individuen auftritt, die zu zwei verschiedenen Arten gehören, während die intraspezifische Hybridisierung zwischen genetisch divergierenden zwei Individuen derselben Spezies auftritt.
Hybridisierung ist der Prozess der Paarung oder Kreuzung genetisch differenzierter Individuen oder Gruppen. Das Hauptziel der Hybridisierung besteht darin, wünschenswerte Gene zu kombinieren, die in verschiedenen Organismen vorhanden sind. Darüber hinaus wird die Hybridisierung zur Herstellung reinrassiger Nachkommen eingesetzt. Die Paarung kann zwischen zwei Individuen derselben Art oder zwischen zwei Individuen der verschiedenen Spezies erfolgen. Basierend darauf gibt es zwei Arten von Hybridisierung: intraspezifische Hybridisierung und interspezifische Hybridisierung.