Der Hauptunterschied zwischen Histopathologie und Zytologie besteht darin, dass die Histopathologie die Untersuchung erkrankter Gewebe unter Verwendung eines Mikroskops ist, während die Zytologie die Untersuchung einzelner Körperzellen ist.
Zellen sind die grundlegenden Struktureinheiten des Lebens. Bei der Diagnose von Krankheiten in der Medizin werden Zellen und ganze Gewebe von Pathologen untersucht. Die Untersuchung von Geweben in Bezug auf Krankheiten ist als Histopathologie bekannt. Im Gegensatz dazu ist die Untersuchung eines einzelnen Zelltyps als Zytologie bekannt. Daher untersucht die Histopathologie Gewebe, während die Zytologie einzelne Zellen untersucht.