Der Hauptunterschied zwischen Opsonisierung und Neutralisation hängt von der Art und Weise ab, wie sie die immunologische Reaktion ausführen. Bei der Opsonisierung werden die Krankheitserreger markiert, bevor sie zerstört werden, während bei der Neutralisation die Wirkung des Krankheitserregers neutralisiert wird.
Immunologische Reaktionen können angeboren oder adaptiv sein. Krankheitserreger besitzen Rezeptoren zur Erkennung von Krankheitserregern, die die Identifizierung durch den Wirt erleichtern. Bei der Opsonisierung produziert der Wirt Opsonine. Bei der Neutralisation produziert der Wirt jedoch neutralisierende Antikörper, um die Wirkung der Antikörper-Antigen-Reaktion zu neutralisieren.
