Der Hauptunterschied zwischen dem Klenow-Fragment und der DNA-Polymerase 1 besteht darin, dass das Klenow-Fragment ein großer Teil der DNA-Polymerase 1 ist, dem die Exonukleaseaktivität von 5 'bis 3' fehlt, während die DNA-Polymerase ein Enzym von E. coli ist, das alle drei Domänen einschließlich 5 'bis aufweist 3'-Exonukleaseaktivität.
DNA-Polymerase ist eines der Schlüsselenzyme, die an der DNA-Replikation in lebenden Organismen beteiligt sind. Es gibt verschiedene Formen von DNA-Polymeraseenzymen, die in Eukaryoten und Prokaryoten gefunden werden, basierend auf der Größe und Form. Die DNA-Polymerase 1, 2 und 3 kommen nur in prokaryotischen Organismen vor und spielen bei der DNA-Replikation eine unterschiedliche Rolle. Die DNA-Polymerase 1 hat drei Domänen mit 5'- bis 3'-Polymerase, 3'- bis 5'-Exonukleaseaktivität und 5'- bis 3'-Exonukleaseaktivität. Das Klenow-Fragment ist ein proteolytisches Produkt der DNA-Polymerase 1. Es besitzt 5 bis 3'-Polymerase- und 3'- bis 5'-Exonukleaseaktivitäten der intakten DNA-Polymerase 1, es fehlt jedoch die 5'- bis 3'-Exonukleaseaktivität.