Der Hauptunterschied zwischen Contig und Gerüst besteht darin, dass ein Contig keine Lücken aufweist, während ein Gerüst aus Contigs und Lücken besteht.
Die Genomsequenzierung von mehrzelligen Organismen ist im Vergleich zur Sequenzierung von einzelligen Organismen sehr schwierig. Die Gesamtgenom-Shotgun-Sequenzierung ist eine einfache und schnelle Genomsequenzierungstechnik für mehrzellige Genome. Es ist eine Methode, die viele überlappende DNA-Fragmente parallel sequenziert. Bei diesem Verfahren werden kleine Fragmente unter Verwendung eines Computers zu größeren Fragmenten und dann zu größeren Contigs zusammengesetzt. Dann werden die Contigs zu Gerüsten und schließlich zu einem Chromosom zusammengesetzt. Daher ist Contig eine kontinuierliche Strecke von Nukleotidsequenzen, während das Gerüst ein Teil des Genoms ist, der aus Contigs und Lücken besteht. Sowohl Contig als auch Scaffold sind rekonstruierte Genomsequenzen.
