Hauptunterschied - VNTR vs STR
DNA-Studien sind immens nützlich, um phylogenetische Beziehungen zu verstehen und zu bestimmen, genetische Krankheiten zu diagnostizieren und die Genome des Organismus zu kartieren. Verschiedene mit der DNA-Analyse verbundene Techniken werden zur Identifizierung eines bestimmten Gens oder einer DNA-Sequenz in einem Pool unbekannter DNA verwendet. Sie sind als genetische Marker bekannt. Genetische Marker werden in der Molekularbiologie verwendet, um genetische Variationen zwischen Individuen und Arten zu identifizieren. Tandem-Wiederholung mit variabler Anzahl (VNTR) und kurze Tandem-Wiederholung (STR) sind zwei Arten von genetischen Markern, die bei Individuen Polymorphismus zeigen. Beide Typen sind nichtkodierende repetitive DNA, die Tandem-Wiederholungen sind. Sie sind in Chromosomen von Kopf bis Schwanz angeordnet. VNTR ist ein Abschnitt des Genoms, in dem die kurze Nukleotidsequenz mehrmals wiederholt wird. STR ist ein weiterer DNA-Abschnitt innerhalb des Genoms, der als Wiederholungseinheiten organisiert ist, die hundertmal aus zwei bis dreizehn Nukleotiden bestehen. Der Hauptunterschied zwischen VNTR und STR ist die Anzahl der Nukleotide in einer sich wiederholenden Sequenz. Wiederholungseinheiten von VNTR bestehen aus 10 bis 100 Nukleotiden, während Wiederholungseinheiten von STR aus 2 bis 13 Nukleotiden bestehen. VNTR und STR werden häufig in forensischen Studien verwendet.
INHALT
1. Überblick und Hauptunterschied
2. Was ist VNTR
? 3. Was ist STR?
4. Ähnlichkeiten zwischen VNTR und STR.
5. Vergleich nebeneinander - VNTR gegen STR in Tabellenform.
6. Zusammenfassung
Was ist VNTR?
Eine Tandemwiederholung ist eine kurze DNA-Sequenz, die an einem bestimmten chromosomalen Ort von Kopf bis Schwanz wiederholt wird. Es gibt keine andere Sequenz oder Nukleotid innerhalb der Tandemwiederholung. Es gibt verschiedene Arten von Tandem-Wiederholungen im Genom. VNTR ist eine Art von Tandem-Wiederholung unter ihnen, die Wiederholungseinheiten aufweist, die aus 10 bis 100 Nukleotiden bestehen. VNTR ist eine Art Minisatellit. Diese Tandem-Wiederholungen können in vielen Chromosomen gefunden werden. Sie sind im menschlichen Genom verteilt und befinden sich überwiegend in den subtelomeren Regionen der Chromosomen.
VNTRs zeigen Tandem-Wiederholungspolymorphismus bei Individuen. Die Länge des VNTR an einem bestimmten Ort des Chromosoms ist bei Individuen aufgrund der Variation in der Anzahl der in diesem DNA-Abschnitt organisierten Wiederholungseinheiten sehr unterschiedlich. Daher kann VNTR als leistungsstarkes Werkzeug zur Identifizierung von Personen verwendet werden, und die VNTR-Analyse wird in vielen Bereichen eingesetzt, einschließlich Genetik, Biologieforschung, Forensik und DNA-Fingerabdruck. VNTRs waren die ersten genetischen Marker, die zur Quantifizierung der Transplantation von Knochenmarktransplantaten verwendet wurden. VNTRs waren auch die ersten polymorphen Marker, die bei der DNA-Profilierung in der Forensik verwendet wurden.
Abbildung 01: Variation von VNTRs bei sechs Personen
Die VNTR-Analyse wird über einen Restriktionsfragmentlängenpolymorphismus gefolgt von einer südlichen Hybridisierung durchgeführt. Daher benötigt es vergleichsweise eine große DNA-Probe. Die Interpretation des VNTR-Profils ist ebenfalls problematisch. Aufgrund dieser Einschränkungen wurde die Verwendung von VNTR in der forensischen Genetik eingeschränkt und durch STR-Analyse ersetzt.
Was ist STR?
STR ist ein sich stark wiederholender DNA-Abschnitt, der aus zwei bis dreizehn Nukleotid-Wiederholungseinheiten besteht, die tandemartig organisiert sind. STR ähnelt VNTR. Es unterscheidet sich von VNTR jedoch von der Anzahl der Nukleotide in einer sich wiederholenden Sequenz und der Anzahl der Wiederholungen. STR ist eine Art Mikrosatellit.
STR-Analyse zur Messung der genauen Anzahl sich wiederholender Einheiten. STRs sind bei Individuen sehr unterschiedlich, ähnlich wie VNTs. STR-Profile unterscheiden sich von Person zu Person. Daher wird die STR-Analyse in der Molekularbiologie verwendet, um spezifische Loci auf DNA aus zwei oder mehr Proben zu vergleichen. Daher werden STRs als starke genetische Marker in der Molekularbiologie angesehen. Es bietet aufgrund seines hohen Polymorphismus und seiner relativ kurzen Länge ein hervorragendes Instrument zur Identifizierung von Personen.
Derzeit sind STRs das am häufigsten verwendete analysierte genetische Polymorphismus-Tool in der forensischen Genetik. Die meisten forensischen Fälle umfassen eine polymorphe STR-Analyse. STR-Loci sind im gesamten Genom verteilt. In Chromosomen befinden sich Tausende von STRs, die für die forensische Analyse verwendet werden können. Die STR-Analyse beinhaltet keinen Restriktionslängenpolymorphismus wie die VNTR-Analyse. Die STR-Analyse schneidet keine DNA mit Restriktionsenzymen. Spezifische Sonden werden verwendet, um gewünschte Regionen an DNA zu binden, und unter Verwendung der PCR-Technik werden die Längen des STR bestimmt.
Abbildung 02: STR-Variation zwischen Proben
Was sind die Ähnlichkeiten zwischen VNTR und STR?
- VNTR und STR sind nichtkodierende DNA.
- Beides sind Tandem-Wiederholungen.
- Beide zeigen Polymorphismus zwischen Individuen aufgrund des Unterschieds in der Länge des DNA-Abschnitts.
- Beide werden als leistungsfähige genetische Marker im DNA-Fingerabdruck und in forensischen Studien verwendet.
Was ist der Unterschied zwischen VNTR und STR?
Diff Artikel Mitte vor Tabelle
VNTR vs STR |
|
| VNTR ist eine nichtkodierende repetitive DNA, bei der eine kurze Nukleotidsequenz tandemartig wiederholt wird. | STR ist ein sich stark wiederholender DNA-Abschnitt, der aus zwei bis dreizehn Nukleotid-Wiederholungseinheiten besteht, die tandemartig organisiert sind. |
| Größe | |
| VNTRs sind größer als STRs. | STRs sind kleiner als VNTRs. |
| Anzahl der Nukleotide in sich wiederholender Sequenz | |
| Die Wiederholungseinheit von VNTR besteht aus 10 bis 100 Nukleotiden. | Die Wiederholungseinheit von STR besteht aus 2 bis 13 Nukleotiden. |
Zusammenfassung - VNTR vs STR
VNTR und STR sind zwei leistungsstarke genetische Marker, die in der Molekularbiologie, insbesondere auf dem Gebiet der forensischen Genetik, verwendet werden. VNTR ist eine Art Minisatellit und STR ist ein Mikrosatellit. VNTR und STR sind nichtkodierende, sich stark wiederholende DNA. Sie sind Tandem-Wiederholungen. Die allgemeine Struktur von VNTR und STR ist dieselbe. Die Anzahl der Nukleotide in der Wiederholungssequenz und die Länge sind jedoch unterschiedlich. VNTR hat sich wiederholende Sequenzen, die aus 10 bis 100 Nukleotiden bestehen. STR hat sich wiederholende Sequenzen, die aus 2 bis 13 Nukleotiden bestehen. Dies ist der Unterschied zwischen VNTR und STR.
Laden Sie die PDF-Version von VNTR vs STR herunter
Sie können die PDF-Version dieses Artikels herunterladen und gemäß den Zitierhinweisen für Offline-Zwecke verwenden. Bitte laden Sie hier die PDF-Version herunter. Unterschied zwischen VNTR und STR.
