Der Hauptunterschied zwischen Akkordaten und Nicht-Akkordaten ergibt sich aus dem Vorhandensein und Fehlen eines Notochords. Chordaten sind Organismen mit einem ausgeprägten Notochord, der sich zur Wirbelsäule entwickelt. Im Gegensatz dazu sind Nicht-Chordaten Organismen, die keine Notochord- oder Wirbelsäule haben.
Chordaten und Nicht-Chordaten sind zwei Phyla, die zum Königreich Animalia gehören. Sie werden basierend auf primären evolutionären Merkmalen charakterisiert. Nach der Evolution entwickelten die Tiere einen Notochord, der sie zu Chordaten machte.