Der Hauptunterschied zwischen Gülle und organischer Substanz besteht darin, dass die Gülle eine Form von organischer Substanz ist, die vom Menschen hergestellt wird, während die organische Substanz die kohlenstoffreichen Verbindungen sind, die auf natürliche Weise im Boden gebildet werden.
Pflanzen sind die Hauptprimärproduzenten in unseren Ökosystemen. Daher sind sie wichtig für die Versorgung anderer Tiere mit Futter und tragen auch zur Aufrechterhaltung des natürlichen Gleichgewichts bei. Pflanzen brauchen auch Nahrung und Wasser, um zu wachsen. Sie sind abhängig vom Boden für Nahrung, Wasser und Lebensraum. Daher muss der Boden in einem gesunden Zustand sein und organische Stoffe sind erforderlich, um die Qualität des Bodens zu erhalten. Organische Substanz sind die kohlenstoffhaltigen Verbindungen. Im Boden gibt es viele Formen organischer Stoffe. Im Gegensatz dazu wird Gülle von Menschen hergestellt und enthält alle wesentlichen Nährstoffe, die für die Verbesserung der Bodengesundheit erforderlich sind. Dementsprechend sind organische Stoffe und Gülle zwei Begriffe, die in der Bodenbiologie und in der Landwirtschaft sehr wichtig sind.