Der Hauptunterschied zwischen Parasiten und Bakterien besteht darin, dass es sich bei den Bakterien um einzellige mikroskopisch kleine Prokaryoten handelt, die überall leben, während Parasiten die Organismen sind, die auf oder in ihren Wirten leben und Infektionen bei Wirten verursachen.
Parasiten und Bakterien sind Organismen, die sehr primitiven Organismen ähneln, sich jedoch stark anpassen, um unter verschiedenen Umweltbedingungen zu überleben. Für den Menschen sind diese Organismen von größter Bedeutung, da die meisten Infektionen beim Menschen durch sie verursacht werden. Manchmal werden bestimmte Bakterien als Parasiten angesehen.