Der Hauptunterschied zwischen Tautomerie und Metamerie besteht darin, dass sich Tautomerie auf das dynamische Gleichgewicht zwischen zwei Verbindungen mit derselben Molekülformel bezieht, während sich Metamerie auf Strukturisomerie bezieht, bei der unterschiedliche Alkylgruppen an dieselbe funktionelle Gruppe gebunden sind.
Isomerie ist die Existenz chemischer Verbindungen mit derselben Strukturformel, aber unterschiedlichen räumlichen Anordnungen. Daher haben Isomere in jedem Element die gleiche Anzahl von Atomen, aber ihre Anordnung ist unterschiedlich. Isomere können hauptsächlich in zwei Gruppen als Strukturisomere und Stereoisomere eingeteilt werden. Tautomerie und Metamerie sind zwei Unterteilungen der Strukturisomerie.