Der Hauptunterschied zwischen Endozytose und Exozytose besteht darin, dass die Endozytose Substanzen in die Zelle bringt, während die Exozytose Substanzen nach außen in die Zelle transportiert.
Eine Zelle hat eine Zellmembran, die als Barriere zwischen dem Zellinneren und der äußeren Umgebung fungiert. Daher benötigen Zellen mit einer solchen Membran eine Art Transportmechanismus, um sich mit der äußeren Umgebung zu verbinden. Zum Beispiel müssen Zellen Nährstoffe erhalten und Abfall aus der Zelle ausscheiden. Zu diesem Zweck verfügen Zellen über vier grundlegende Transportmechanismen: Diffusion, Osmose, aktiver Transport und Massentransport. Diffusion und Osmose sind passive Prozesse, während aktiver Transport und Massentransport aktive Prozesse sind, die Energie verbrauchen. Endozytose und Exozytose sind zwei Arten von Massentransportmechanismen, die große Partikel durch die Plasmamembran transportieren, entweder von der Zelle zur äußeren Umgebung oder von der äußeren Umgebung zur Zelle. Beide Mechanismen bilden membrangebundene Vesikel als Transportmittel.
