Der Hauptunterschied zwischen Wirbeltieren und Chordaten besteht darin, dass die Wirbeltiere ein Hauptunterphylum von Chordaten sind, die eine Wirbelsäule aufweisen, während die Chordaten hochentwickelte Tiere sind, die einen Notochord, ein Rückenmark, Pharyngealschlitze, einen Endostil und einen Postanal besitzen Schwanz während eines bestimmten Zeitraums ihrer Lebensspanne.
Wirbeltiere sind eine Hauptgruppe von Akkordaten in Bezug auf die Anzahl der Arten, die evolutionäre Raffinesse und viele andere Aspekte. Darüber hinaus glauben viele Menschen, dass Akkordaten mit Wirbeltieren identisch sind. Zu den Akkordaten gehören jedoch zwei weitere Subphyla als die Wirbeltiere. Sie sind Subphylum Tunicata (oder Urochordata) und Subphylum Cephalochordata. Daher sind nicht alle Chordaten Wirbeltiere, aber alle Wirbeltiere sind Chordaten. In diesem Artikel wird daher versucht, den bestehenden Unterschied zwischen Wirbeltieren und Akkordaten im Detail hervorzuheben.