Der Hauptunterschied zwischen Protostele und Siphonostele besteht darin, dass Protostele die primitivste Art von Stele ist, die aus einem festen Xylemkern ohne zentrales Mark besteht, während Siphonostel eine Modifikation des Protostels ist, das aus einem zylindrischen Gefäßsystem besteht, das ein zentrales Mark umgibt.
Die Stele ist der zentrale Teil eines Stammes oder einer Wurzel, der aus Gefäßgewebe und anderen Grundgeweben besteht. Stele hat Gewebe, die aus dem Prokambium stammen, wie Gefäßgewebe, Mark, Pericyclus usw. Mit einfachen Worten, Stele ist der zentrale Bereich, den die Endodermis umgibt. Protostele und Siphonostele sind zwei Arten von Stelen, die in Pflanzen vorkommen. Protostele ist die primitivste Art von Stele, die in niederen Pflanzen vorhanden ist, während Siphonostele eine viel fortgeschrittenere Stele ist, die in anderen Pflanzen vorhanden ist.