Der Hauptunterschied zwischen Prototheria Metatheria und Eutheria besteht darin, dass sich Prototheria auf eierlegende Säugetiere bezieht, während sich Metatheria auf Beuteltiere bezieht, die teilweise entwickelte junge Tiere zur Welt bringen, und Eutheria auf plazentare Säugetiere, die gut entwickelte junge Tiere zur Welt bringen.
Aufgrund der großen Unterschiede in den Fortpflanzungssystemen können Säugetiere in drei Unterklassen eingeteilt werden: Prototheria, Metatheria und Eutheria. Prototheria umfasst die primitivsten Säugetiere, bei denen es sich um eierlegende Säugetiere handelt, insbesondere um Monotreme. Metatheria umfasst Beuteltiere, während Eutheria echte Plazentasäugetiere umfasst. Tatsächlich ist Eutheria die größte Unterklasse von Säugetieren.
