Der Hauptunterschied zwischen polycyclischen und mehrkernigen aromatischen Kohlenwasserstoffen besteht darin, dass der Begriff polycyclischer aromatischer Kohlenwasserstoff das Vorhandensein von zwei oder mehr miteinander verschmolzenen cyclischen Strukturen beschreibt, während der Begriff mehrkerniger aromatischer Kohlenwasserstoff das Vorhandensein von mehr als einem Atom beschreibt.
Die Begriffe polycyclische aromatische Kohlenwasserstoffe und mehrkernige aromatische Kohlenwasserstoffe beziehen sich auf dieselbe Gruppe organischer Verbindungen, die mehrere cyclische Strukturen aus Kohlenstoff und Wasserstoff enthält, die miteinander fusioniert sind und ein großes organisches Molekül bilden. Der Unterschied zwischen polycyclischen und mehrkernigen aromatischen Kohlenwasserstoffen liegt jedoch in der Beschreibung der einzelnen Begriffe; Polyzyklisch bezieht sich auf "viele Zyklen", während mehrkernig auf "viele Atome" verweist.