Der Hauptunterschied zwischen Transaldolase und Transketolase ist ihre Funktion. Transaldolase katalysiert die Umwandlung von Sedoheptulose 7-Phosphat und Glycerinaldehyden 3-Phosphat in Erythrose 4-Phosphat und Fructose 6-Phosphat, während Transketolase die Umwandlung von Xylulose 5-Phosphat und Ribose 5-Phosphat in Glycerinaldehyd 3-Phosphat und Sedoheptulose 7-Phosphat katalysiert.
Der Pentose-Phosphat-Weg ist ein Stoffwechselweg, der parallel zur Glykolyse stattfindet. Es besteht aus zwei unterschiedlichen Wegen. Im Pentosephosphatweg wird NADPH in der oxidativen Phase erzeugt, während Pentosezucker in der nichtoxidativen Phase erzeugt werden. Zusätzlich zu Pentosen und NADPH erzeugt dieser Weg Ribose-5-phosphat, das ein Vorläufer für die Nukleotidsynthese ist. Transaldolase und Transketolase sind zwei Enzyme, die an der nichtoxidativen Phase des Pentosephosphatweges beteiligt sind.