Der Hauptunterschied zwischen Umkehrphasen- und Normalphasen-HPLC besteht darin, dass die Umkehrphasen-HPLC eine unpolare stationäre Phase und eine polare mobile Phase verwendet, während die Normalphasen-HPLC eine polare stationäre Phase und eine weniger polare mobile Phase verwendet.
Die Normalphasen-HPLC ist die älteste HPLC-Technik, die Tswett bei der Trennung von Pflanzenextrakten verwendete. Er benutzte Kreide in einer Glassäule. Dies war die klassische Art der Chromatographie, die dazu führte, dass sie als „normale“Technik bezeichnet wurde. Die Umkehrphasen-HPLC ist dagegen das Gegenteil der normalen Technik, die Wissenschaftler in letzter Zeit entwickelt haben.