Der Hauptunterschied zwischen Calciumhypochlorit und Natriumhypochlorit besteht darin, dass das Calciumhypochlorit zwei Hypochloritanionen enthält, die mit einem Calciumkation assoziiert sind, während Natriumhypochlorit ein Hypochloritanion enthält, das mit einem Natriumkation assoziiert ist. Im Aussehen ist Calciumhypochlorit ein weißes bis graues Pulver, während Natriumhypochlorit ein grünlich-gelber Feststoff mit einem süßen Geruch ist.
Calcium- und Natriumhypochlorit sind ionische Verbindungen, die ein Metallkation und ein von Chlor abgeleitetes Anion enthalten. Die Anzahl der Anionen pro Kation dieser Verbindungen unterscheidet sich je nach Wertigkeit des Metallkations voneinander.
