Der Hauptunterschied zwischen Chaperons und Chaperoninen besteht darin, dass die Chaperone eine breite Palette von Funktionen erfüllen, einschließlich Faltung und Abbau des Proteins, Unterstützung bei der Proteinassemblierung usw., während die Schlüsselfunktion von Chaperoninen darin besteht, die Faltung großer Proteinmoleküle zu unterstützen.
Molekulare Chaperons oder Chaperone sind Proteinmoleküle, die den Prozess der Faltung von Proteinen in komplexe Strukturen unterstützen. Daher sind Chaperonine eine Art von Chaperon, das Hitzeschockproteine enthält. Von allen Arten von Chaperonen sind Chaperonine die am häufigsten untersuchten Proteine, da sie eine wichtige Rolle bei der korrekten Proteinfaltung spielen. Daher verhindert die Wirkung von Chaperonen und Chaperoninen die irreversible Aggregation von Proteinen und ermöglicht dadurch deren Funktionalität. Chaperone und Chaperonine unterscheiden sich geringfügig aufgrund der Funktionalität der beiden Moleküle.