Der Hauptunterschied zwischen Gameten und Gametophyten besteht darin, dass der Gameten die Geschlechtszelle ist, die von den Geschlechtsorganen des Gametophyten produziert wird, während der Gametophyt das männliche oder weibliche haploide Stadium des Lebenszyklus bestimmter Organismen einschließlich Pflanzen und Algen ist.
Im Lebenszyklus von Pflanzen und bestimmten Organismen sind männliche und weibliche Gametophyten zu sehen. Männliche Gametophyten produzieren männliche Gameten, während weibliche Gametophyten weibliche Gameten produzieren. Männliche und weibliche Gameten sind die haploiden Geschlechtszellen oder Keimzellen, die eine sexuelle Fortpflanzung beinhalten. Sie durchlaufen einen Befruchtungsprozess und produzieren eine diploide Zygote, die sich zu einem völlig neuen Individuum entwickeln kann.