Der Hauptunterschied zwischen Bioakkumulation und Biomagnifikation besteht darin, dass sich Bioakkumulation auf den Aufbau einer toxischen Chemikalie im Körper eines lebenden Organismus bezieht, während die Biomagnifikation die Erhöhung der Konzentration einer toxischen Chemikalie entlang einer Nahrungskette ist.
Nahrungsketten sind wichtige Wechselbeziehungen zwischen den Organismen in den Ökosystemen. Es beginnt mit einem Primärproduzenten, hauptsächlich einer Pflanze, die photoautotrop ist. Pflanzen produzieren Nahrung für sich selbst unter Verwendung von Sonnenlicht und anorganischen Kohlenstoffquellen. Pflanzenfresser besetzen die zweite Ebene einer Nahrungskette. Die nächsten Ebenen werden üblicherweise von Allesfressern und Fleischfressern besetzt. Nahrungsketten erklären gut die Abhängigkeit jeder Ebene für Lebensmittel. Ebenso wird das auf der unteren Ebene produzierte Lebensmittel an die oberen Ebenen weitergegeben. Zusammen mit dem Essen können alle Substanzen in den unteren trophischen Ebenen zusammen mit den Nährstoffen auch auf die oberen Ebenen übertragen werden. Bioakkumulation und Biomagnifikation sind zwei Phänomene, die mit dem Übergang von Schadstoffen entlang der Nahrungsketten in die oberen Ebenen zusammenhängen.