Der Hauptunterschied zwischen Transformation und Transduktion besteht darin, dass Transformation ein Mechanismus ist, der das genetische Material von Bakterien verändert, indem er exogenes genetisches Material aus seiner Umgebung durch die Zellmembran direkt aufnimmt und in das Genom einbaut, während die Transduktion die Injektion von Fremd-DNA durch ist ein Bakteriophagenvirus in das Wirtsbakterium.
Die Konjugation ist eine bekannte Methode zur DNA-Rekombination, die sowohl in Eukaryoten als auch in Prokaryoten zu finden ist. Wissenschaftler haben entdeckt, dass es möglich ist, DNA durch zwei weitere Mechanismen von einer Bakterienzelle auf eine andere zu übertragen: Transformation und Transduktion. Ähnlich wie bei der Konjugation übertragen diese beiden Mechanismen DNA in eine Richtung, und die Rekombination erfolgt zwischen Allelen in homologen DNA-Regionen. Beide Mechanismen übertragen nur sehr wenige DNA-Mengen und nicht das gesamte Zellchromosom.
