Der Hauptunterschied zwischen Metagenomik und Metatranskriptomik hängt von der Art der in jedem Bereich untersuchten Biomoleküle ab. Die Metagenomik untersucht die DNA, ihre Sequenzen und ihr Verhalten in Organismen, während die Metatranskriptomik die transkribierte DNA, hauptsächlich mRNA-Sequenzen, und ihr Verhalten in Organismen untersucht.
Metagenomik und Metatranskriptomik sind zwei Bereiche, die im Laufe der Jahre in Bezug auf die mikrobielle Gemeinschaft an Popularität gewonnen haben. Sie sind wichtig im Gesundheitswesen, in der Industrie und in der Agrarbiotechnologie. Sowohl die Metagenomik als auch die Metatranskriptomik ermöglichen die Untersuchung einzelner Organismen in einer Gemeinschaft und ihrer funktionellen Rollen, die entweder nützlich oder schädlich sind.
