Der Hauptunterschied zwischen Dikaryon und Heterokaryon besteht darin, dass sich Dikaryon auf eine Pilzzelle bezieht, die genau zwei genetisch unterschiedliche Kerne innerhalb desselben Zytoplasmas enthält, während sich Heterokaryon auf eine Zelle bezieht, die zwei oder mehr genetisch unterschiedliche Kerne innerhalb eines gemeinsamen Zytoplasmas enthält.
Plasmogamie und Karyogamie sind zwei Prozesse der sexuellen Reproduktion. Im Allgemeinen tritt Plasmogamie vor Karyogamie auf. Während der Plasmogamie verschmelzen Zellmembranen der beiden Paarungstypen miteinander zu einer gemeinsamen Zelle. Während der Karyogamie verschmelzen zwei genetisch unterschiedliche Kerne miteinander. Manchmal folgt die Karyogamie nicht unmittelbar auf die Plasmogamie. Zu diesem Zeitpunkt existieren zwei oder mehr Kerne in einem gemeinsamen Zytoplasma. Dikaryon und Heterokaryon sind zwei solche Zustände.
