Der Hauptunterschied zwischen männlichem und weiblichem Gametophyten hängt von der Art der Zelle ab, die die beiden Strukturen produziert. Mikrosporen produzieren den männlichen Gametophyten, während Makrosporen den weiblichen Gametophyten produzieren.
Männliche und weibliche Gametophyten entstehen aus Heterosporen. Sie führen bei Algen und Pflanzen zum sexuellen Fortpflanzungszyklus. Diese Organismen zeigen jedoch auch einen Generationswechsel zwischen der sporophytischen und der gametophytischen Generation. Männliche und weibliche Gametophyten produzieren ihre jeweiligen männlichen und weiblichen Gameten, die für die sexuelle Fortpflanzung notwendig sind. Wenn zwei Gameten miteinander verschmelzen, bildet sich eine diploide Zelle, die als Zygote bekannt ist, und setzt sich in der sporophytischen Erzeugung fort.