Der Hauptunterschied zwischen maximaler Sparsamkeit und maximaler Wahrscheinlichkeit hängt von der Methode ab, die bei der Entwicklung des phylogenetischen Baums verwendet wird. Maximale Sparsamkeit konzentriert sich auf die Minimierung der Gesamtcharakterzustände während der phylogenetischen Baumkonstruktion, während die maximale Wahrscheinlichkeit ein statistischer Ansatz beim Zeichnen des phylogenetischen Baums in Abhängigkeit von der Wahrscheinlichkeit zwischen genetischen Daten ist.
Die Phylogenie ist der neuartige Ansatz zur Klassifizierung und Nomenklatur von Organismen. Die Phylogenie beruht auf genetischen Daten und evolutionären Beziehungen. Die genetischen Daten sind ein Ergebnis der DNA-Sequenzierung. In der Phylogenie erfolgt die Klassifizierung von Organismen anhand des gemeinsamen Vorfahren. Maximale Sparsamkeit und maximale Wahrscheinlichkeit einer phylogenetischen Beziehung erhöhen die Genauigkeit und Zuverlässigkeit eines phylogenetischen Baums.
