Der Hauptunterschied zwischen zufälligen Primern und Oligo-dT besteht darin, dass der zufällige Primer eine Mischung aller möglichen Hexamer-Oligonukleotidsequenzen ist, während der Oligo-dT-Primer aus einem einzelsträngigen Abschnitt von 12–18 Desoxythymidinen besteht.
Die reverse Transkription ist ein Mechanismus, bei dem cDNA unter Verwendung von mRNA oder einer beliebigen RNA-Spezies synthetisiert werden kann. Zur Herstellung von cDNA sollten das reverse Transkriptaseenzym und andere notwendige Komponenten bereitgestellt werden, insbesondere Matrize und Primer. Primer sind die kurzen DNA-Sequenzen, die speziell für die Amplifikation der Zielsequenzen entwickelt wurden. Zufällige Primer und Oligo-dT-Primer sind zwei übliche Arten von Primern, die bei der reversen Transkription verwendet werden. Daher sind zufälliger Primer oder Oligo-dT-Primer kurze DNA-Oligonukleotidsequenzen, die erforderlich sind, damit die reverse Transkriptase die reverse Transkription initiiert. Abhängig von der RNA-Matrize kann aus diesen beiden Primertypen der geeignete Primer ausgewählt werden.
