Der Hauptunterschied zwischen Allozymen und Isozymen besteht darin, dass Allozyme von verschiedenen Allelen am gleichen Ort codiert werden. Im Gegensatz dazu werden Isozyme jedoch von Genen an verschiedenen Orten codiert.
Enzyme sind Biokatalysatoren, die biochemische Reaktionen beschleunigen. Tatsächlich sind sie Proteinmoleküle, die von Genen codiert werden. Es gibt verschiedene Arten von Enzymen. Einige Enzyme werden von verschiedenen Allelen desselben Gens codiert, die am gleichen Ort vorhanden sind. Sie sind als Allozyme bekannt. Im Gegensatz dazu werden einige Enzyme von verschiedenen Genen codiert, die sich an verschiedenen Orten befinden. Diese Enzyme sind als Isozyme bekannt. Isozyme und Allozyme können verwendet werden, um die Beziehung zwischen zwei Organismen zu bestimmen.