Der Hauptunterschied zwischen Mastigomycotina und Zygomycota besteht darin, dass Mastigomycotina eine polyphyletische Gruppe von Pilzen ist, die Flagellenzellen produzieren und Rhizoide aufweisen, während Zygomycota eine Teilung von Pilzen ist, die während der sexuellen Reproduktion charakteristische resistente kugelförmige Sporen, sogenannte Zygosporen, produzieren.
Pilze sind filamentöse eukaryotische Organismen, die zu Kingdom Fungi gehören. Sie produzieren sowohl sexuelle als auch asexuelle Sporen. Sie können Saprophyten oder Parasiten sein. Es gibt verschiedene Arten von Pilzgruppen. Die Hauptgruppen sind Mastigomycotina, Zygomycota, Ascomycota, Basidiomycota und Deuteromycota. Mastigomycotina besteht aus zoosporischen Pilzen, bei denen viele ausschließlich aquatisch sind. Zygomycota-Pilze sind konjugative Pilze, die charakteristische Zygosporen produzieren. Ascomycota-Pilze sind Sackpilze, die eine sackartige Struktur namens Ascus produzieren. Basidiomycota-Pilze bilden eine keulenförmige Struktur, die als Basidium bezeichnet wird. Deuteromycota-Pilze sind Pilze imperfecti, was bedeutet, dass sie nur den asexuellen oder mycelischen Zustand haben.
