Der Hauptunterschied zwischen O- und H-Antigen besteht darin, dass O-Antigen der äußerste Teil der Oberflächenbedeckung des Bakteriums ist, während H-Antigen die schlanke fadenförmige Struktur ist, die Teil der Flagellen ist.
Antigene sind molekulare Erkennungsstellen, die in vielen Bakterien, Pilzen, Viren, Staubpartikeln und anderen zellulären und nichtzellulären Partikeln vorhanden sind, die vom Immunsystem des Wirts erkannt werden könnten. Im Allgemeinen sind die meisten Antigene auf der Zelloberfläche vorhanden. Strukturell können Antigene Proteine, Aminosäuren, Lipide, Glykolipide oder Glykoproteine oder Nukleinsäuremarker sein. Diese Moleküle besitzen eine spezifische Fähigkeit, eine Immunantwort im Wirt hervorzurufen. Diese Immunantwort wird durch Auslösen der Produktion von Antikörpern als entsprechendes Ergebnis hervorgerufen.
Antigene werden im Allgemeinen im Serotyp-Identifikationssystem für die Bakterien verwendet. Salmonellen sind eine Bakteriengattung mit vielen Serotypen. Serotypen sind Gruppen von Mikroorganismen innerhalb derselben Spezies. Diese Serotypen können unter Verwendung der Kombination von O-Antigen und H-Antigen unterschieden werden. O-Antigen ist eine LPS-Seitenkette, während H-Antigen ein Teil der Flagellen ist.
